Sant Jordi Desvalls forma part de la comarca del Gironès, província de Girona.

El terme municipal té una extensió de 12 km2 i 57 m. d'altitud.

Els límits del terme municipal són al nord amb Viladasens, a l'est amb Colomers i Foixà, al sud amb Flaçà i Sant Joan de Molllet a l'oest amb Cervià de Ter i Viladasens.

Té agregats els nuclis de Sant Mateu, Sobrànigues, el Veïnat de Diana i el Veïnat de Mas Masó.