El topònim més antic de la contrada es refereix a « Riodazar », d'etimologia encara discutida. Però el que si se sap, és que el 852 fou erigit el monestir de Santa Maria, pel comte Vifred de Besalu.

L'església és sens dubte una de les més antigues fundacions monàstiques de la Garrotxa. La vila de Riudaura, patí els estralls de diversos esdeveniments quan les guerres carlines, fins a la signatura de la pau de l'hostal de la Corda.