Llers forma part de la comarca de l'Alt Empordà, província de Girona.

El terme municipal té una extensió de 21 km2 i 142 m. d'altitud.

Els límits del terme municipal són al nord amb Pont de Molins, a l'est amb Figueres, al sud amb Avinyonet de Puigventós i a l'oest amb Cistella i Boadella d'Empordà.

Té agregats els nuclis de El Poblenou, Els Hostalets i La Vall.